Protein–RNA interactions for Protein: P41271

NBL1, Neuroblastoma suppressor of tumorigenicity 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBL1P41271 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NBL1P41271 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NBL1P41271 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NBL1P41271 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NBL1P41271 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NBL1P41271 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NBL1P41271 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NBL1P41271 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBL1P41271 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBL1P41271 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBL1P41271 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NBL1P41271 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBL1P41271 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBL1P41271 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBL1P41271 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBL1P41271 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBL1P41271 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBL1P41271 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBL1P41271 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBL1P41271 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBL1P41271 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBL1P41271 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBL1P41271 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBL1P41271 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBL1P41271 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBL1P41271 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBL1P41271 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBL1P41271 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBL1P41271 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NBL1P41271 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBL1P41271 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NBL1P41271 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NBL1P41271 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBL1P41271 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBL1P41271 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBL1P41271 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBL1P41271 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBL1P41271 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBL1P41271 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBL1P41271 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBL1P41271 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NBL1P41271 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NBL1P41271 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NBL1P41271 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NBL1P41271 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBL1P41271 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBL1P41271 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NBL1P41271 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBL1P41271 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBL1P41271 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBL1P41271 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBL1P41271 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBL1P41271 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBL1P41271 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBL1P41271 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBL1P41271 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBL1P41271 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NBL1P41271 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NBL1P41271 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBL1P41271 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBL1P41271 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBL1P41271 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBL1P41271 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBL1P41271 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBL1P41271 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBL1P41271 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NBL1P41271 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBL1P41271 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NBL1P41271 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBL1P41271 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBL1P41271 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBL1P41271 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBL1P41271 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBL1P41271 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBL1P41271 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBL1P41271 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NBL1P41271 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBL1P41271 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NBL1P41271 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBL1P41271 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBL1P41271 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NBL1P41271 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NBL1P41271 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NBL1P41271 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBL1P41271 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBL1P41271 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NBL1P41271 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBL1P41271 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBL1P41271 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBL1P41271 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBL1P41271 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBL1P41271 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBL1P41271 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NBL1P41271 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBL1P41271 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NBL1P41271 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBL1P41271 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBL1P41271 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBL1P41271 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NBL1P41271 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms