Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MDH1P40925 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MDH1P40925 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MDH1P40925 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MDH1P40925 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MDH1P40925 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MDH1P40925 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MDH1P40925 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MDH1P40925 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MDH1P40925 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MDH1P40925 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MDH1P40925 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDH1P40925 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDH1P40925 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDH1P40925 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDH1P40925 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDH1P40925 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDH1P40925 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDH1P40925 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDH1P40925 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MDH1P40925 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDH1P40925 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDH1P40925 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDH1P40925 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MDH1P40925 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MDH1P40925 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDH1P40925 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDH1P40925 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDH1P40925 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDH1P40925 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDH1P40925 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDH1P40925 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDH1P40925 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDH1P40925 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDH1P40925 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDH1P40925 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDH1P40925 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDH1P40925 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDH1P40925 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDH1P40925 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDH1P40925 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDH1P40925 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDH1P40925 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDH1P40925 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MDH1P40925 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDH1P40925 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDH1P40925 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDH1P40925 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDH1P40925 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDH1P40925 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDH1P40925 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDH1P40925 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDH1P40925 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDH1P40925 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDH1P40925 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDH1P40925 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDH1P40925 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDH1P40925 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDH1P40925 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDH1P40925 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MDH1P40925 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDH1P40925 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDH1P40925 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDH1P40925 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDH1P40925 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MDH1P40925 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MDH1P40925 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MDH1P40925 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDH1P40925 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDH1P40925 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDH1P40925 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDH1P40925 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDH1P40925 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDH1P40925 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDH1P40925 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDH1P40925 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDH1P40925 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDH1P40925 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDH1P40925 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDH1P40925 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDH1P40925 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDH1P40925 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDH1P40925 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDH1P40925 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDH1P40925 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDH1P40925 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDH1P40925 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDH1P40925 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDH1P40925 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDH1P40925 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDH1P40925 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDH1P40925 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDH1P40925 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDH1P40925 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDH1P40925 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDH1P40925 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDH1P40925 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDH1P40925 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDH1P40925 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDH1P40925 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms