Protein–RNA interactions for Protein: P35250

RFC2, Replication factor C subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC2P35250 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFC2P35250 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC2P35250 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC2P35250 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC2P35250 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC2P35250 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFC2P35250 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC2P35250 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC2P35250 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC2P35250 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC2P35250 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC2P35250 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC2P35250 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFC2P35250 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC2P35250 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC2P35250 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC2P35250 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFC2P35250 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFC2P35250 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFC2P35250 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFC2P35250 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFC2P35250 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RFC2P35250 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RFC2P35250 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC2P35250 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC2P35250 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC2P35250 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC2P35250 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC2P35250 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC2P35250 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RFC2P35250 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC2P35250 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC2P35250 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RFC2P35250 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFC2P35250 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFC2P35250 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFC2P35250 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFC2P35250 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RFC2P35250 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RFC2P35250 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFC2P35250 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFC2P35250 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFC2P35250 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFC2P35250 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFC2P35250 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFC2P35250 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFC2P35250 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFC2P35250 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFC2P35250 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFC2P35250 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFC2P35250 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFC2P35250 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFC2P35250 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFC2P35250 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFC2P35250 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFC2P35250 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFC2P35250 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFC2P35250 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RFC2P35250 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFC2P35250 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFC2P35250 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RFC2P35250 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFC2P35250 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFC2P35250 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFC2P35250 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RFC2P35250 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFC2P35250 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFC2P35250 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFC2P35250 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC2P35250 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC2P35250 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC2P35250 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC2P35250 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC2P35250 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC2P35250 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC2P35250 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFC2P35250 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFC2P35250 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFC2P35250 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFC2P35250 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFC2P35250 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFC2P35250 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFC2P35250 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFC2P35250 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFC2P35250 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RFC2P35250 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RFC2P35250 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFC2P35250 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFC2P35250 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFC2P35250 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFC2P35250 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFC2P35250 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFC2P35250 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFC2P35250 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFC2P35250 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFC2P35250 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFC2P35250 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFC2P35250 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFC2P35250 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RFC2P35250 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms