Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC1P35052 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC1P35052 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC1P35052 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC1P35052 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC1P35052 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC1P35052 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC1P35052 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC1P35052 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC1P35052 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC1P35052 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC1P35052 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC1P35052 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC1P35052 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC1P35052 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC1P35052 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC1P35052 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC1P35052 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPC1P35052 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC1P35052 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC1P35052 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC1P35052 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC1P35052 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC1P35052 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC1P35052 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC1P35052 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC1P35052 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC1P35052 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC1P35052 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC1P35052 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPC1P35052 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC1P35052 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC1P35052 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC1P35052 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPC1P35052 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC1P35052 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC1P35052 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC1P35052 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC1P35052 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC1P35052 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC1P35052 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC1P35052 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC1P35052 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPC1P35052 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC1P35052 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC1P35052 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC1P35052 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC1P35052 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPC1P35052 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC1P35052 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC1P35052 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC1P35052 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC1P35052 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC1P35052 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC1P35052 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC1P35052 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPC1P35052 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC1P35052 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC1P35052 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC1P35052 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC1P35052 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC1P35052 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC1P35052 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPC1P35052 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC1P35052 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC1P35052 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC1P35052 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC1P35052 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPC1P35052 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC1P35052 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC1P35052 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC1P35052 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC1P35052 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC1P35052 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC1P35052 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC1P35052 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC1P35052 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC1P35052 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC1P35052 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC1P35052 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC1P35052 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC1P35052 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC1P35052 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC1P35052 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC1P35052 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC1P35052 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC1P35052 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC1P35052 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC1P35052 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC1P35052 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC1P35052 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC1P35052 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC1P35052 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC1P35052 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC1P35052 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC1P35052 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC1P35052 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC1P35052 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC1P35052 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC1P35052 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms