Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH5P33151 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH5P33151 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH5P33151 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH5P33151 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH5P33151 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH5P33151 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH5P33151 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH5P33151 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH5P33151 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH5P33151 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH5P33151 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH5P33151 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH5P33151 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH5P33151 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH5P33151 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH5P33151 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH5P33151 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH5P33151 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH5P33151 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH5P33151 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH5P33151 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH5P33151 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH5P33151 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH5P33151 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH5P33151 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH5P33151 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH5P33151 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH5P33151 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH5P33151 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH5P33151 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH5P33151 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH5P33151 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH5P33151 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH5P33151 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH5P33151 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH5P33151 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH5P33151 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH5P33151 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH5P33151 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH5P33151 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH5P33151 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH5P33151 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH5P33151 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH5P33151 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH5P33151 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH5P33151 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH5P33151 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH5P33151 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH5P33151 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH5P33151 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH5P33151 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH5P33151 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH5P33151 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH5P33151 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH5P33151 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH5P33151 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH5P33151 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH5P33151 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH5P33151 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH5P33151 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH5P33151 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH5P33151 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH5P33151 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH5P33151 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH5P33151 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH5P33151 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH5P33151 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH5P33151 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH5P33151 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH5P33151 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH5P33151 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH5P33151 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH5P33151 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH5P33151 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH5P33151 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH5P33151 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH5P33151 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH5P33151 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH5P33151 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH5P33151 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH5P33151 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH5P33151 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH5P33151 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH5P33151 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH5P33151 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH5P33151 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH5P33151 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH5P33151 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH5P33151 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH5P33151 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH5P33151 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH5P33151 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH5P33151 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH5P33151 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH5P33151 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH5P33151 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH5P33151 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH5P33151 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH5P33151 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms