Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BRS3P32247 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRS3P32247 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRS3P32247 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRS3P32247 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BRS3P32247 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRS3P32247 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRS3P32247 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRS3P32247 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRS3P32247 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRS3P32247 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRS3P32247 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRS3P32247 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRS3P32247 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRS3P32247 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BRS3P32247 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRS3P32247 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRS3P32247 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRS3P32247 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRS3P32247 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRS3P32247 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRS3P32247 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRS3P32247 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRS3P32247 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRS3P32247 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRS3P32247 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRS3P32247 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRS3P32247 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRS3P32247 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRS3P32247 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRS3P32247 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRS3P32247 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRS3P32247 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRS3P32247 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRS3P32247 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRS3P32247 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BRS3P32247 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRS3P32247 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRS3P32247 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRS3P32247 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BRS3P32247 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRS3P32247 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRS3P32247 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRS3P32247 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRS3P32247 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRS3P32247 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRS3P32247 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRS3P32247 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRS3P32247 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BRS3P32247 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRS3P32247 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRS3P32247 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRS3P32247 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRS3P32247 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRS3P32247 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRS3P32247 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRS3P32247 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BRS3P32247 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BRS3P32247 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRS3P32247 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRS3P32247 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRS3P32247 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRS3P32247 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRS3P32247 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRS3P32247 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRS3P32247 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRS3P32247 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRS3P32247 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRS3P32247 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRS3P32247 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRS3P32247 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRS3P32247 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRS3P32247 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRS3P32247 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRS3P32247 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRS3P32247 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRS3P32247 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRS3P32247 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRS3P32247 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRS3P32247 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRS3P32247 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRS3P32247 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRS3P32247 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRS3P32247 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRS3P32247 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRS3P32247 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRS3P32247 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRS3P32247 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRS3P32247 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRS3P32247 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRS3P32247 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRS3P32247 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRS3P32247 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRS3P32247 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRS3P32247 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRS3P32247 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRS3P32247 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRS3P32247 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRS3P32247 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRS3P32247 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms