Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD11P31277 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD11P31277 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD11P31277 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms