Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC13P31276 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXC13P31276 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms