Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECHS1P30084 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECHS1P30084 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ECHS1P30084 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms