Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CD40LGP29965 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD40LGP29965 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD40LGP29965 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms