Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHC1P29353 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHC1P29353 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHC1P29353 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHC1P29353 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHC1P29353 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHC1P29353 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHC1P29353 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHC1P29353 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHC1P29353 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHC1P29353 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHC1P29353 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHC1P29353 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SHC1P29353 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHC1P29353 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHC1P29353 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHC1P29353 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHC1P29353 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHC1P29353 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHC1P29353 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHC1P29353 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHC1P29353 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHC1P29353 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHC1P29353 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHC1P29353 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHC1P29353 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHC1P29353 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHC1P29353 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHC1P29353 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHC1P29353 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHC1P29353 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHC1P29353 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHC1P29353 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SHC1P29353 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHC1P29353 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHC1P29353 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHC1P29353 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHC1P29353 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHC1P29353 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHC1P29353 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHC1P29353 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHC1P29353 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHC1P29353 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHC1P29353 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHC1P29353 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHC1P29353 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHC1P29353 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHC1P29353 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHC1P29353 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHC1P29353 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHC1P29353 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHC1P29353 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHC1P29353 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHC1P29353 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHC1P29353 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHC1P29353 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SHC1P29353 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHC1P29353 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SHC1P29353 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHC1P29353 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHC1P29353 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHC1P29353 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHC1P29353 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHC1P29353 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHC1P29353 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHC1P29353 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHC1P29353 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHC1P29353 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHC1P29353 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHC1P29353 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHC1P29353 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHC1P29353 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHC1P29353 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHC1P29353 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHC1P29353 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHC1P29353 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SHC1P29353 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHC1P29353 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHC1P29353 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SHC1P29353 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHC1P29353 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHC1P29353 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHC1P29353 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHC1P29353 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHC1P29353 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SHC1P29353 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHC1P29353 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHC1P29353 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHC1P29353 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHC1P29353 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SHC1P29353 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SHC1P29353 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHC1P29353 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHC1P29353 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHC1P29353 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHC1P29353 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHC1P29353 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHC1P29353 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHC1P29353 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHC1P29353 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms