Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHA3P29320 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA3P29320 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA3P29320 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms