Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD38P28907 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD38P28907 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD38P28907 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD38P28907 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD38P28907 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD38P28907 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD38P28907 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD38P28907 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD38P28907 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD38P28907 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD38P28907 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CD38P28907 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD38P28907 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD38P28907 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD38P28907 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD38P28907 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD38P28907 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD38P28907 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD38P28907 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD38P28907 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD38P28907 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD38P28907 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD38P28907 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CD38P28907 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD38P28907 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD38P28907 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD38P28907 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD38P28907 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD38P28907 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD38P28907 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD38P28907 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD38P28907 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD38P28907 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD38P28907 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD38P28907 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD38P28907 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD38P28907 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD38P28907 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD38P28907 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD38P28907 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD38P28907 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD38P28907 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD38P28907 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD38P28907 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD38P28907 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD38P28907 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD38P28907 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD38P28907 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD38P28907 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD38P28907 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD38P28907 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD38P28907 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD38P28907 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD38P28907 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD38P28907 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD38P28907 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CD38P28907 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD38P28907 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CD38P28907 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD38P28907 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD38P28907 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CD38P28907 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD38P28907 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD38P28907 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD38P28907 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CD38P28907 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD38P28907 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD38P28907 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD38P28907 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD38P28907 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD38P28907 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD38P28907 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD38P28907 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD38P28907 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD38P28907 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD38P28907 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD38P28907 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD38P28907 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD38P28907 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD38P28907 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CD38P28907 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD38P28907 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD38P28907 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD38P28907 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CD38P28907 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD38P28907 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD38P28907 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD38P28907 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD38P28907 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD38P28907 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD38P28907 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD38P28907 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD38P28907 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD38P28907 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD38P28907 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD38P28907 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD38P28907 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD38P28907 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD38P28907 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms