Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTR1EP28566 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HTR1EP28566 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms