Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VARSP26640 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VARSP26640 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VARSP26640 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VARSP26640 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VARSP26640 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VARSP26640 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VARSP26640 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VARSP26640 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VARSP26640 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VARSP26640 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VARSP26640 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VARSP26640 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VARSP26640 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VARSP26640 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VARSP26640 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VARSP26640 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VARSP26640 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VARSP26640 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VARSP26640 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VARSP26640 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VARSP26640 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VARSP26640 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VARSP26640 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VARSP26640 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VARSP26640 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VARSP26640 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VARSP26640 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VARSP26640 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VARSP26640 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VARSP26640 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VARSP26640 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VARSP26640 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VARSP26640 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VARSP26640 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VARSP26640 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VARSP26640 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VARSP26640 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VARSP26640 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VARSP26640 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VARSP26640 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VARSP26640 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VARSP26640 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VARSP26640 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VARSP26640 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VARSP26640 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VARSP26640 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VARSP26640 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VARSP26640 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VARSP26640 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VARSP26640 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VARSP26640 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VARSP26640 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VARSP26640 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VARSP26640 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VARSP26640 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VARSP26640 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VARSP26640 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VARSP26640 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VARSP26640 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VARSP26640 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VARSP26640 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VARSP26640 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VARSP26640 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VARSP26640 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VARSP26640 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VARSP26640 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VARSP26640 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARSP26640 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARSP26640 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARSP26640 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARSP26640 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARSP26640 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARSP26640 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARSP26640 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARSP26640 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VARSP26640 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VARSP26640 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VARSP26640 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VARSP26640 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VARSP26640 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VARSP26640 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VARSP26640 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VARSP26640 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VARSP26640 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VARSP26640 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VARSP26640 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VARSP26640 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VARSP26640 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VARSP26640 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VARSP26640 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VARSP26640 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VARSP26640 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VARSP26640 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VARSP26640 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VARSP26640 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VARSP26640 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VARSP26640 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VARSP26640 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VARSP26640 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms