Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTX3P26022 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTX3P26022 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTX3P26022 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTX3P26022 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTX3P26022 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTX3P26022 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTX3P26022 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTX3P26022 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTX3P26022 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTX3P26022 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTX3P26022 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTX3P26022 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTX3P26022 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTX3P26022 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTX3P26022 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTX3P26022 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTX3P26022 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTX3P26022 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTX3P26022 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTX3P26022 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTX3P26022 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTX3P26022 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTX3P26022 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTX3P26022 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTX3P26022 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTX3P26022 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTX3P26022 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTX3P26022 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTX3P26022 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTX3P26022 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTX3P26022 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTX3P26022 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTX3P26022 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTX3P26022 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTX3P26022 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTX3P26022 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTX3P26022 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTX3P26022 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTX3P26022 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTX3P26022 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTX3P26022 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTX3P26022 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTX3P26022 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTX3P26022 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTX3P26022 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTX3P26022 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTX3P26022 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTX3P26022 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTX3P26022 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTX3P26022 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTX3P26022 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTX3P26022 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTX3P26022 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTX3P26022 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTX3P26022 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTX3P26022 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTX3P26022 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTX3P26022 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTX3P26022 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTX3P26022 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTX3P26022 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTX3P26022 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTX3P26022 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTX3P26022 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTX3P26022 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTX3P26022 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTX3P26022 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTX3P26022 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTX3P26022 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTX3P26022 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTX3P26022 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTX3P26022 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTX3P26022 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTX3P26022 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTX3P26022 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTX3P26022 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTX3P26022 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTX3P26022 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTX3P26022 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTX3P26022 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTX3P26022 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTX3P26022 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTX3P26022 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTX3P26022 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTX3P26022 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTX3P26022 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTX3P26022 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTX3P26022 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTX3P26022 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTX3P26022 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTX3P26022 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTX3P26022 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTX3P26022 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTX3P26022 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTX3P26022 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTX3P26022 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTX3P26022 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTX3P26022 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTX3P26022 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms