Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND1P24385 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCND1P24385 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND1P24385 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND1P24385 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND1P24385 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND1P24385 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND1P24385 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND1P24385 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND1P24385 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND1P24385 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND1P24385 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND1P24385 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND1P24385 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND1P24385 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCND1P24385 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND1P24385 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND1P24385 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND1P24385 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND1P24385 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND1P24385 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND1P24385 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND1P24385 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCND1P24385 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND1P24385 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND1P24385 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND1P24385 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND1P24385 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND1P24385 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCND1P24385 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND1P24385 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND1P24385 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCND1P24385 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND1P24385 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND1P24385 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND1P24385 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND1P24385 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND1P24385 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCND1P24385 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND1P24385 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND1P24385 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND1P24385 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND1P24385 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND1P24385 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND1P24385 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND1P24385 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCND1P24385 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND1P24385 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND1P24385 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND1P24385 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCND1P24385 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND1P24385 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND1P24385 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND1P24385 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND1P24385 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND1P24385 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND1P24385 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND1P24385 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND1P24385 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND1P24385 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCND1P24385 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND1P24385 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND1P24385 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND1P24385 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND1P24385 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCND1P24385 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCND1P24385 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND1P24385 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND1P24385 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND1P24385 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND1P24385 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND1P24385 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND1P24385 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND1P24385 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND1P24385 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND1P24385 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND1P24385 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND1P24385 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND1P24385 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND1P24385 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCND1P24385 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND1P24385 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND1P24385 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND1P24385 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND1P24385 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCND1P24385 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCND1P24385 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCND1P24385 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCND1P24385 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCND1P24385 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCND1P24385 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCND1P24385 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCND1P24385 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCND1P24385 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCND1P24385 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCND1P24385 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCND1P24385 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCND1P24385 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCND1P24385 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCND1P24385 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms