Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA2P24043 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA2P24043 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA2P24043 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA2P24043 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA2P24043 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA2P24043 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA2P24043 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA2P24043 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA2P24043 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA2P24043 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA2P24043 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA2P24043 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA2P24043 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMA2P24043 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LAMA2P24043 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms