Protein–RNA interactions for Protein: P22680

CYP7A1, Cholesterol 7-alpha-monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP7A1P22680 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CYP7A1P22680 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP7A1P22680 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CYP7A1P22680 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP7A1P22680 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms