Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FGFR3P22607 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FGFR3P22607 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FGFR3P22607 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms