Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN1P21941 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN1P21941 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MATN1P21941 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN1P21941 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN1P21941 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MATN1P21941 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN1P21941 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN1P21941 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN1P21941 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN1P21941 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN1P21941 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN1P21941 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN1P21941 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN1P21941 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN1P21941 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN1P21941 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MATN1P21941 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN1P21941 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN1P21941 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN1P21941 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN1P21941 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN1P21941 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN1P21941 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN1P21941 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN1P21941 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN1P21941 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN1P21941 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN1P21941 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN1P21941 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MATN1P21941 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN1P21941 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN1P21941 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN1P21941 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN1P21941 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN1P21941 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN1P21941 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN1P21941 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN1P21941 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MATN1P21941 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN1P21941 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN1P21941 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN1P21941 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN1P21941 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MATN1P21941 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN1P21941 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN1P21941 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN1P21941 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN1P21941 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN1P21941 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN1P21941 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN1P21941 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN1P21941 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN1P21941 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN1P21941 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MATN1P21941 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MATN1P21941 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MATN1P21941 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MATN1P21941 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MATN1P21941 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MATN1P21941 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MATN1P21941 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN1P21941 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN1P21941 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN1P21941 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN1P21941 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN1P21941 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN1P21941 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MATN1P21941 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MATN1P21941 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MATN1P21941 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MATN1P21941 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MATN1P21941 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MATN1P21941 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MATN1P21941 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MATN1P21941 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MATN1P21941 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN1P21941 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN1P21941 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN1P21941 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN1P21941 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN1P21941 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MATN1P21941 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MATN1P21941 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN1P21941 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN1P21941 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN1P21941 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN1P21941 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN1P21941 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN1P21941 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN1P21941 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN1P21941 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN1P21941 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN1P21941 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MATN1P21941 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN1P21941 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN1P21941 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN1P21941 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN1P21941 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MATN1P21941 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms