Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB5AP20339 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB5AP20339 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms