Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATP2B1P20020 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP2B1P20020 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2B1P20020 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms