Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFEBP19484 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TFEBP19484 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TFEBP19484 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TFEBP19484 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TFEBP19484 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TFEBP19484 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFEBP19484 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFEBP19484 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFEBP19484 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFEBP19484 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TFEBP19484 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFEBP19484 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFEBP19484 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFEBP19484 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFEBP19484 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFEBP19484 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFEBP19484 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFEBP19484 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFEBP19484 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFEBP19484 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFEBP19484 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFEBP19484 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TFEBP19484 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFEBP19484 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFEBP19484 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFEBP19484 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFEBP19484 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFEBP19484 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFEBP19484 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TFEBP19484 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFEBP19484 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFEBP19484 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFEBP19484 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TFEBP19484 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFEBP19484 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFEBP19484 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFEBP19484 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TFEBP19484 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFEBP19484 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFEBP19484 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFEBP19484 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFEBP19484 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFEBP19484 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TFEBP19484 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFEBP19484 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFEBP19484 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TFEBP19484 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFEBP19484 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFEBP19484 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFEBP19484 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFEBP19484 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFEBP19484 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFEBP19484 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TFEBP19484 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFEBP19484 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFEBP19484 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFEBP19484 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFEBP19484 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFEBP19484 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFEBP19484 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFEBP19484 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TFEBP19484 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFEBP19484 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFEBP19484 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFEBP19484 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFEBP19484 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFEBP19484 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TFEBP19484 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFEBP19484 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TFEBP19484 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFEBP19484 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFEBP19484 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFEBP19484 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFEBP19484 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TFEBP19484 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFEBP19484 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFEBP19484 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFEBP19484 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFEBP19484 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFEBP19484 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFEBP19484 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFEBP19484 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TFEBP19484 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFEBP19484 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFEBP19484 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFEBP19484 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFEBP19484 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFEBP19484 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TFEBP19484 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFEBP19484 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFEBP19484 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFEBP19484 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TFEBP19484 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFEBP19484 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TFEBP19484 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFEBP19484 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFEBP19484 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFEBP19484 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TFEBP19484 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms