Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH2P19022 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH2P19022 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH2P19022 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH2P19022 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH2P19022 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH2P19022 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH2P19022 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH2P19022 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH2P19022 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH2P19022 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH2P19022 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH2P19022 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH2P19022 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH2P19022 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH2P19022 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH2P19022 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH2P19022 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH2P19022 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH2P19022 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH2P19022 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH2P19022 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH2P19022 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH2P19022 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH2P19022 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH2P19022 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH2P19022 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH2P19022 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH2P19022 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH2P19022 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH2P19022 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH2P19022 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH2P19022 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH2P19022 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH2P19022 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH2P19022 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH2P19022 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH2P19022 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH2P19022 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH2P19022 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH2P19022 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH2P19022 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH2P19022 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH2P19022 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH2P19022 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH2P19022 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH2P19022 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH2P19022 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH2P19022 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH2P19022 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH2P19022 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH2P19022 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH2P19022 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH2P19022 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH2P19022 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH2P19022 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH2P19022 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH2P19022 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH2P19022 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH2P19022 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH2P19022 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH2P19022 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH2P19022 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH2P19022 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH2P19022 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH2P19022 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH2P19022 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH2P19022 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH2P19022 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH2P19022 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH2P19022 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH2P19022 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH2P19022 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH2P19022 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH2P19022 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH2P19022 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH2P19022 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH2P19022 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH2P19022 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH2P19022 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH2P19022 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH2P19022 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH2P19022 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH2P19022 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH2P19022 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH2P19022 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH2P19022 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH2P19022 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH2P19022 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH2P19022 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH2P19022 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH2P19022 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH2P19022 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH2P19022 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH2P19022 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH2P19022 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH2P19022 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH2P19022 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH2P19022 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH2P19022 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms