Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR1P18146 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR1P18146 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR1P18146 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR1P18146 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR1P18146 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR1P18146 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR1P18146 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR1P18146 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR1P18146 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR1P18146 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR1P18146 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR1P18146 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR1P18146 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR1P18146 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR1P18146 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR1P18146 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR1P18146 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR1P18146 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR1P18146 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR1P18146 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR1P18146 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR1P18146 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR1P18146 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR1P18146 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR1P18146 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR1P18146 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR1P18146 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR1P18146 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR1P18146 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR1P18146 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR1P18146 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR1P18146 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR1P18146 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR1P18146 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR1P18146 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EGR1P18146 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR1P18146 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR1P18146 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR1P18146 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR1P18146 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR1P18146 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR1P18146 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR1P18146 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR1P18146 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EGR1P18146 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR1P18146 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR1P18146 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR1P18146 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR1P18146 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR1P18146 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR1P18146 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR1P18146 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR1P18146 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR1P18146 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR1P18146 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EGR1P18146 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR1P18146 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR1P18146 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR1P18146 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR1P18146 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR1P18146 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR1P18146 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR1P18146 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR1P18146 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR1P18146 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR1P18146 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR1P18146 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR1P18146 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR1P18146 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EGR1P18146 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR1P18146 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR1P18146 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR1P18146 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR1P18146 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR1P18146 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR1P18146 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR1P18146 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR1P18146 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EGR1P18146 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR1P18146 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR1P18146 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR1P18146 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR1P18146 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR1P18146 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR1P18146 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR1P18146 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR1P18146 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR1P18146 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EGR1P18146 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR1P18146 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR1P18146 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR1P18146 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR1P18146 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR1P18146 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR1P18146 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR1P18146 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR1P18146 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR1P18146 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EGR1P18146 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms