Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ITGB5P18084 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGB5P18084 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB5P18084 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGB5P18084 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGB5P18084 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB5P18084 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB5P18084 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB5P18084 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB5P18084 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB5P18084 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB5P18084 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB5P18084 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB5P18084 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB5P18084 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB5P18084 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB5P18084 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB5P18084 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms