Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GM2AP17900 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GM2AP17900 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GM2AP17900 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GM2AP17900 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GM2AP17900 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GM2AP17900 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GM2AP17900 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GM2AP17900 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GM2AP17900 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GM2AP17900 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GM2AP17900 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GM2AP17900 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GM2AP17900 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GM2AP17900 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GM2AP17900 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GM2AP17900 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GM2AP17900 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GM2AP17900 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GM2AP17900 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GM2AP17900 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GM2AP17900 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GM2AP17900 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GM2AP17900 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GM2AP17900 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GM2AP17900 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GM2AP17900 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GM2AP17900 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GM2AP17900 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GM2AP17900 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GM2AP17900 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GM2AP17900 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GM2AP17900 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GM2AP17900 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GM2AP17900 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GM2AP17900 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GM2AP17900 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GM2AP17900 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GM2AP17900 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GM2AP17900 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GM2AP17900 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GM2AP17900 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GM2AP17900 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GM2AP17900 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GM2AP17900 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GM2AP17900 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GM2AP17900 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GM2AP17900 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GM2AP17900 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GM2AP17900 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GM2AP17900 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GM2AP17900 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GM2AP17900 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GM2AP17900 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GM2AP17900 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GM2AP17900 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GM2AP17900 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GM2AP17900 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GM2AP17900 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GM2AP17900 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GM2AP17900 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GM2AP17900 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GM2AP17900 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GM2AP17900 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GM2AP17900 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GM2AP17900 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GM2AP17900 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GM2AP17900 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GM2AP17900 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GM2AP17900 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GM2AP17900 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GM2AP17900 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GM2AP17900 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GM2AP17900 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GM2AP17900 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GM2AP17900 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GM2AP17900 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GM2AP17900 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GM2AP17900 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GM2AP17900 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GM2AP17900 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GM2AP17900 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GM2AP17900 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GM2AP17900 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GM2AP17900 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GM2AP17900 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GM2AP17900 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GM2AP17900 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GM2AP17900 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GM2AP17900 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GM2AP17900 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GM2AP17900 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GM2AP17900 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GM2AP17900 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GM2AP17900 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GM2AP17900 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GM2AP17900 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GM2AP17900 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GM2AP17900 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GM2AP17900 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms