Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTPS1P17812 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTPS1P17812 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms