Protein–RNA interactions for Protein: P17038

ZNF43, Zinc finger protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF43P17038 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF43P17038 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF43P17038 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZNF43P17038 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF43P17038 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF43P17038 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF43P17038 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF43P17038 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF43P17038 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF43P17038 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF43P17038 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF43P17038 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF43P17038 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF43P17038 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF43P17038 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZNF43P17038 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms