Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GATA1P15976 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GATA1P15976 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GATA1P15976 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GATA1P15976 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GATA1P15976 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATA1P15976 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATA1P15976 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATA1P15976 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GATA1P15976 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATA1P15976 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATA1P15976 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATA1P15976 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GATA1P15976 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATA1P15976 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATA1P15976 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATA1P15976 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATA1P15976 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATA1P15976 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GATA1P15976 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GATA1P15976 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA1P15976 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA1P15976 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA1P15976 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA1P15976 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA1P15976 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA1P15976 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA1P15976 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA1P15976 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA1P15976 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GATA1P15976 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA1P15976 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA1P15976 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA1P15976 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA1P15976 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA1P15976 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA1P15976 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA1P15976 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA1P15976 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA1P15976 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA1P15976 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA1P15976 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GATA1P15976 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA1P15976 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA1P15976 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA1P15976 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA1P15976 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA1P15976 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA1P15976 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA1P15976 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA1P15976 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA1P15976 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA1P15976 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GATA1P15976 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA1P15976 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA1P15976 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA1P15976 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA1P15976 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA1P15976 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA1P15976 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA1P15976 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA1P15976 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA1P15976 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GATA1P15976 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA1P15976 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA1P15976 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA1P15976 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA1P15976 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA1P15976 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA1P15976 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA1P15976 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA1P15976 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA1P15976 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA1P15976 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA1P15976 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA1P15976 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GATA1P15976 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA1P15976 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA1P15976 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA1P15976 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GATA1P15976 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms