Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCP1P13796 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCP1P13796 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LCP1P13796 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCP1P13796 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LCP1P13796 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCP1P13796 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCP1P13796 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCP1P13796 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCP1P13796 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCP1P13796 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCP1P13796 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCP1P13796 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCP1P13796 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCP1P13796 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCP1P13796 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCP1P13796 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LCP1P13796 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LCP1P13796 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LCP1P13796 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCP1P13796 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCP1P13796 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCP1P13796 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCP1P13796 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCP1P13796 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCP1P13796 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCP1P13796 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCP1P13796 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LCP1P13796 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCP1P13796 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCP1P13796 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCP1P13796 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCP1P13796 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LCP1P13796 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCP1P13796 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCP1P13796 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCP1P13796 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCP1P13796 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCP1P13796 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCP1P13796 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCP1P13796 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCP1P13796 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCP1P13796 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCP1P13796 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCP1P13796 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LCP1P13796 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCP1P13796 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCP1P13796 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCP1P13796 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCP1P13796 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCP1P13796 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCP1P13796 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LCP1P13796 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCP1P13796 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCP1P13796 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCP1P13796 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCP1P13796 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCP1P13796 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCP1P13796 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCP1P13796 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCP1P13796 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCP1P13796 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LCP1P13796 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCP1P13796 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCP1P13796 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LCP1P13796 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCP1P13796 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LCP1P13796 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCP1P13796 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCP1P13796 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCP1P13796 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCP1P13796 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCP1P13796 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCP1P13796 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCP1P13796 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCP1P13796 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCP1P13796 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCP1P13796 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCP1P13796 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCP1P13796 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCP1P13796 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCP1P13796 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCP1P13796 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCP1P13796 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCP1P13796 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCP1P13796 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCP1P13796 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCP1P13796 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCP1P13796 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCP1P13796 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCP1P13796 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCP1P13796 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCP1P13796 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCP1P13796 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCP1P13796 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCP1P13796 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCP1P13796 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCP1P13796 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCP1P13796 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCP1P13796 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms