Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT5P13647 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT5P13647 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT5P13647 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT5P13647 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT5P13647 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT5P13647 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT5P13647 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT5P13647 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT5P13647 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT5P13647 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT5P13647 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT5P13647 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT5P13647 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT5P13647 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT5P13647 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT5P13647 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT5P13647 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT5P13647 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT5P13647 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT5P13647 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT5P13647 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT5P13647 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT5P13647 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT5P13647 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT5P13647 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT5P13647 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT5P13647 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT5P13647 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT5P13647 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT5P13647 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT5P13647 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT5P13647 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT5P13647 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT5P13647 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT5P13647 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT5P13647 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT5P13647 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT5P13647 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT5P13647 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT5P13647 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT5P13647 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT5P13647 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT5P13647 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT5P13647 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT5P13647 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT5P13647 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT5P13647 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT5P13647 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT5P13647 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT5P13647 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT5P13647 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT5P13647 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT5P13647 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT5P13647 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT5P13647 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT5P13647 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT5P13647 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT5P13647 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT5P13647 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT5P13647 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT5P13647 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT5P13647 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT5P13647 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT5P13647 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT5P13647 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT5P13647 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT5P13647 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT5P13647 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT5P13647 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT5P13647 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT5P13647 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT5P13647 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT5P13647 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT5P13647 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT5P13647 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT5P13647 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT5P13647 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT5P13647 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT5P13647 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT5P13647 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT5P13647 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT5P13647 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT5P13647 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT5P13647 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT5P13647 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT5P13647 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT5P13647 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT5P13647 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT5P13647 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT5P13647 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT5P13647 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT5P13647 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT5P13647 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT5P13647 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT5P13647 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT5P13647 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT5P13647 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT5P13647 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT5P13647 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms