Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GP1BBP13224 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GP1BBP13224 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms