Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MS4A1P11836 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MS4A1P11836 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MS4A1P11836 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MS4A1P11836 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MS4A1P11836 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
MS4A1P11836 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MS4A1P11836 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MS4A1P11836 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MS4A1P11836 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MS4A1P11836 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MS4A1P11836 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MS4A1P11836 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MS4A1P11836 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms