Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYGBP11216 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYGBP11216 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYGBP11216 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYGBP11216 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYGBP11216 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYGBP11216 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYGBP11216 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYGBP11216 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYGBP11216 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYGBP11216 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYGBP11216 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYGBP11216 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYGBP11216 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYGBP11216 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYGBP11216 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYGBP11216 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYGBP11216 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYGBP11216 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PYGBP11216 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PYGBP11216 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PYGBP11216 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PYGBP11216 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PYGBP11216 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PYGBP11216 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PYGBP11216 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PYGBP11216 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PYGBP11216 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PYGBP11216 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PYGBP11216 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PYGBP11216 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PYGBP11216 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PYGBP11216 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PYGBP11216 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PYGBP11216 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PYGBP11216 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PYGBP11216 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYGBP11216 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYGBP11216 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYGBP11216 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYGBP11216 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYGBP11216 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYGBP11216 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYGBP11216 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYGBP11216 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYGBP11216 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYGBP11216 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYGBP11216 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYGBP11216 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYGBP11216 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYGBP11216 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYGBP11216 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYGBP11216 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PYGBP11216 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PYGBP11216 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PYGBP11216 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PYGBP11216 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PYGBP11216 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PYGBP11216 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PYGBP11216 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PYGBP11216 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYGBP11216 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYGBP11216 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYGBP11216 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYGBP11216 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYGBP11216 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYGBP11216 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYGBP11216 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYGBP11216 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYGBP11216 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYGBP11216 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYGBP11216 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PYGBP11216 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PYGBP11216 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PYGBP11216 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PYGBP11216 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PYGBP11216 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PYGBP11216 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PYGBP11216 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PYGBP11216 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PYGBP11216 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PYGBP11216 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PYGBP11216 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PYGBP11216 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PYGBP11216 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PYGBP11216 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PYGBP11216 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PYGBP11216 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PYGBP11216 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PYGBP11216 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PYGBP11216 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PYGBP11216 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PYGBP11216 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PYGBP11216 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PYGBP11216 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PYGBP11216 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PYGBP11216 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PYGBP11216 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PYGBP11216 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PYGBP11216 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms