Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GLI3P10071 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GLI3P10071 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GLI3P10071 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GLI3P10071 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GLI3P10071 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
GLI3P10071 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
GLI3P10071 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
GLI3P10071 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GLI3P10071 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GLI3P10071 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GLI3P10071 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GLI3P10071 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GLI3P10071 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GLI3P10071 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GLI3P10071 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GLI3P10071 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
GLI3P10071 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
GLI3P10071 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GLI3P10071 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GLI3P10071 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
GLI3P10071 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GLI3P10071 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
GLI3P10071 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
GLI3P10071 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GLI3P10071 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GLI3P10071 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
GLI3P10071 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GLI3P10071 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GLI3P10071 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GLI3P10071 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
GLI3P10071 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GLI3P10071 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GLI3P10071 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GLI3P10071 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GLI3P10071 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
GLI3P10071 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
GLI3P10071 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
GLI3P10071 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GLI3P10071 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GLI3P10071 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GLI3P10071 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GLI3P10071 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GLI3P10071 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GLI3P10071 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GLI3P10071 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GLI3P10071 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
GLI3P10071 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GLI3P10071 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GLI3P10071 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GLI3P10071 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
GLI3P10071 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GLI3P10071 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GLI3P10071 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GLI3P10071 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GLI3P10071 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GLI3P10071 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GLI3P10071 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GLI3P10071 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GLI3P10071 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
GLI3P10071 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
GLI3P10071 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GLI3P10071 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GLI3P10071 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GLI3P10071 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GLI3P10071 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GLI3P10071 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GLI3P10071 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GLI3P10071 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GLI3P10071 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GLI3P10071 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GLI3P10071 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GLI3P10071 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GLI3P10071 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GLI3P10071 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GLI3P10071 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GLI3P10071 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GLI3P10071 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GLI3P10071 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GLI3P10071 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GLI3P10071 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GLI3P10071 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GLI3P10071 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
GLI3P10071 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GLI3P10071 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GLI3P10071 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GLI3P10071 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GLI3P10071 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GLI3P10071 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GLI3P10071 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GLI3P10071 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GLI3P10071 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GLI3P10071 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GLI3P10071 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GLI3P10071 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GLI3P10071 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GLI3P10071 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GLI3P10071 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GLI3P10071 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GLI3P10071 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms