Protein–RNA interactions for Protein: P0DP03

IGHV3-30-5, Immunoglobulin heavy variable 3-30-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-5P0DP03 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IGHV3-30-5P0DP03 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGHV3-30-5P0DP03 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms