Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC192P0DO97 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC192P0DO97 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms