Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM49P0CI25 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM49P0CI25 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM49P0CI25 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms