Protein–RNA interactions for Protein: P0CF51

TRGC1, T-cell receptor gamma chain C region 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGC1P0CF51 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRGC1P0CF51 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRGC1P0CF51 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRGC1P0CF51 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms