Protein–RNA interactions for Protein: P09105

HBQ1, Hemoglobin subunit theta-1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBQ1P09105 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HBQ1P09105 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HBQ1P09105 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HBQ1P09105 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HBQ1P09105 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HBQ1P09105 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HBQ1P09105 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HBQ1P09105 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HBQ1P09105 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HBQ1P09105 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HBQ1P09105 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HBQ1P09105 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HBQ1P09105 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HBQ1P09105 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HBQ1P09105 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HBQ1P09105 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HBQ1P09105 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms