Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB1P08183 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms