Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI1P08151 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI1P08151 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI1P08151 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI1P08151 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI1P08151 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI1P08151 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI1P08151 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI1P08151 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI1P08151 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI1P08151 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GLI1P08151 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI1P08151 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI1P08151 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI1P08151 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI1P08151 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GLI1P08151 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI1P08151 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI1P08151 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI1P08151 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI1P08151 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI1P08151 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GLI1P08151 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI1P08151 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI1P08151 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI1P08151 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI1P08151 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI1P08151 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GLI1P08151 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI1P08151 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GLI1P08151 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI1P08151 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI1P08151 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI1P08151 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI1P08151 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI1P08151 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GLI1P08151 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI1P08151 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI1P08151 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI1P08151 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI1P08151 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI1P08151 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI1P08151 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI1P08151 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI1P08151 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI1P08151 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI1P08151 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI1P08151 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GLI1P08151 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLI1P08151 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLI1P08151 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLI1P08151 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLI1P08151 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GLI1P08151 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI1P08151 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI1P08151 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI1P08151 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI1P08151 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI1P08151 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GLI1P08151 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLI1P08151 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLI1P08151 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLI1P08151 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLI1P08151 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLI1P08151 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GLI1P08151 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI1P08151 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GLI1P08151 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GLI1P08151 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GLI1P08151 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GLI1P08151 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI1P08151 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI1P08151 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI1P08151 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI1P08151 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI1P08151 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI1P08151 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI1P08151 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GLI1P08151 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI1P08151 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI1P08151 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI1P08151 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI1P08151 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI1P08151 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI1P08151 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI1P08151 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI1P08151 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GLI1P08151 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI1P08151 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI1P08151 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI1P08151 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI1P08151 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GLI1P08151 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI1P08151 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI1P08151 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI1P08151 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI1P08151 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI1P08151 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI1P08151 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GLI1P08151 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms