Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGFRP08138 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGFRP08138 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGFRP08138 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGFRP08138 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NGFRP08138 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGFRP08138 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGFRP08138 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NGFRP08138 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGFRP08138 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGFRP08138 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGFRP08138 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGFRP08138 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NGFRP08138 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGFRP08138 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGFRP08138 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGFRP08138 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGFRP08138 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGFRP08138 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NGFRP08138 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NGFRP08138 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGFRP08138 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGFRP08138 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGFRP08138 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NGFRP08138 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGFRP08138 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGFRP08138 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGFRP08138 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGFRP08138 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NGFRP08138 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGFRP08138 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGFRP08138 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGFRP08138 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGFRP08138 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGFRP08138 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGFRP08138 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGFRP08138 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGFRP08138 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGFRP08138 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NGFRP08138 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGFRP08138 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGFRP08138 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGFRP08138 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NGFRP08138 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGFRP08138 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGFRP08138 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGFRP08138 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGFRP08138 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NGFRP08138 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NGFRP08138 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NGFRP08138 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NGFRP08138 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NGFRP08138 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NGFRP08138 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NGFRP08138 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NGFRP08138 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NGFRP08138 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NGFRP08138 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NGFRP08138 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NGFRP08138 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NGFRP08138 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NGFRP08138 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NGFRP08138 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NGFRP08138 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NGFRP08138 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NGFRP08138 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NGFRP08138 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NGFRP08138 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NGFRP08138 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NGFRP08138 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NGFRP08138 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NGFRP08138 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NGFRP08138 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NGFRP08138 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NGFRP08138 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NGFRP08138 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NGFRP08138 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NGFRP08138 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NGFRP08138 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NGFRP08138 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NGFRP08138 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NGFRP08138 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NGFRP08138 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NGFRP08138 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NGFRP08138 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NGFRP08138 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NGFRP08138 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NGFRP08138 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NGFRP08138 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NGFRP08138 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NGFRP08138 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NGFRP08138 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NGFRP08138 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NGFRP08138 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NGFRP08138 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NGFRP08138 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NGFRP08138 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NGFRP08138 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NGFRP08138 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NGFRP08138 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms