Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGAVP06756 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGAVP06756 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms