Protein–RNA interactions for Protein: P06732

CKM, Creatine kinase M-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMP06732 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CKMP06732 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKMP06732 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKMP06732 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKMP06732 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKMP06732 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKMP06732 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKMP06732 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKMP06732 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CKMP06732 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CKMP06732 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CKMP06732 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CKMP06732 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKMP06732 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKMP06732 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKMP06732 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CKMP06732 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKMP06732 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKMP06732 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CKMP06732 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKMP06732 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKMP06732 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKMP06732 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKMP06732 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CKMP06732 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKMP06732 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CKMP06732 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CKMP06732 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CKMP06732 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMP06732 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMP06732 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMP06732 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMP06732 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMP06732 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMP06732 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMP06732 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMP06732 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMP06732 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMP06732 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKMP06732 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKMP06732 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKMP06732 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKMP06732 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKMP06732 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKMP06732 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKMP06732 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CKMP06732 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKMP06732 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKMP06732 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKMP06732 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKMP06732 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKMP06732 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKMP06732 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKMP06732 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKMP06732 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CKMP06732 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKMP06732 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKMP06732 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKMP06732 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKMP06732 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKMP06732 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKMP06732 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKMP06732 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKMP06732 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CKMP06732 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKMP06732 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKMP06732 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKMP06732 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKMP06732 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKMP06732 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKMP06732 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKMP06732 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMP06732 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMP06732 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMP06732 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMP06732 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMP06732 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMP06732 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMP06732 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMP06732 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMP06732 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMP06732 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMP06732 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMP06732 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKMP06732 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKMP06732 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKMP06732 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKMP06732 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKMP06732 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKMP06732 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKMP06732 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKMP06732 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKMP06732 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKMP06732 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKMP06732 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKMP06732 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKMP06732 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CKMP06732 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CKMP06732 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKMP06732 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms