Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP1B1P05026 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP1B1P05026 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP1B1P05026 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1B1P05026 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP1B1P05026 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms