Protein–RNA interactions for Protein: P01137

TGFB1, Transforming growth factor beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1P01137 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TGFB1P01137 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TGFB1P01137 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TGFB1P01137 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms