Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SERPINA1P01009 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SERPINA1P01009 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms